Основные направления научной деятельности института: фундаментальные и прикладные научные исследования в области региональной геологии, полезных ископаемых, физической географии, геоэкологии и инженерной геологии.

В институте геологии работают 72 сотрудника, из них 37 научных сотрудников, 6 докторов наук и 14 кандидатов наук. Исполняющий обязанности директора – Бакиров Айзек Асанбекович.

Развитие геологических наук в Кыргызстане началось в 1943 году. Изначально институт был организован как Геологический институт при Кыргызском филиале Академии наук СССР. Деятельность института направлена на геологическое изучение недр и разработку научных основ. В первую очередь проводились научные исследования стратегически важных видов минерального сырья: ртути, горючего топлива, других видов руд, сурьмы, вольфрама, золота, железа, марганца, а также нерудных полезных ископаемых. Выполнялись работы по теории формирования руд, изучению древних пород, процессам осадконакопления, а также по формированию геологических структур.

За достижения в развитии геологических наук и подготовке высококвалифицированных кадров институт в 1969 году был награжден орденом Трудового Красного Знамени. В 1979 году институту было присвоено имя академика М.М. Адышева, который более 20 лет возглавлял институт и внес значительный вклад в создание первого в стране научного учреждения.

Научные лаборатории:

лаборатория тектоники и стратиграфии;

лаборатория металлогении и рудообразования;

лаборатория метаморфических формаций;

лаборатория инженерной и экологической геологии.

Наиболее важным фундаментальным исследованием является научное открытие академика Апаса Бакирова – «Закон неразрывной связи двойственности систем». Оно зарегистрировано в Российской академии естественных наук и подтверждено Международной академией авторов научных открытий и изобретений 14 февраля 2021 года. Апасу Бакирову были вручены серебряная медаль и удостоверение «Автор научного открытия» имени известного русского физика, лауреата Нобелевской премии Петра Капицы, а также диплом № 70-S о научном открытии.